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Les scientifiques établissent un pipeline qui peut être utilisé pour explorer les causes des MII – Actualite-sante

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Les maladies de l'intestin sont souvent notoirement difficiles à diagnostiquer, ne comprend pas, c'est là qu'intervient une approche basée sur les réseaux. Plutôt que d'essayer de comprendre les symptômes individuels ou le rôle des gènes individuels, nous pouvons utiliser des méthodes de calcul pour obtenir cette compréhension plus profonde – en regardant comment les gènes fonctionnent ensemble dans des systèmes complexes, et comment ceux-ci échouent dans une maladie.

Le groupe Korcsmaros de l'IE et du QIB a donc lancé un pipeline expérimental et informatique combiné qui nous dit quels gènes sont importants «maîtres régulateurs» dans l'intestin, et lesquels de ces gènes chevauchent ceux associés à l'IBD, suggérant de nouveaux angles de recherche à l'avenir.

Une grande partie de cela nous oblige à regarder les cellules dans l'intestin. Les cellules de Paneth libèrent des peptides antimicrobiens pour protéger l'intestin des agents pathogènes et les cellules caliciformes libèrent du mucus pour créer une barrière protectrice. La dérégulation de leur fonction est impliquée dans des maladies telles que les MICI.

Une méthode prometteuse pour comprendre le rôle de ces cellules a récemment été introduite. Connues sous le nom d'organoïdes, les cellules souches peuvent être cultivées à partir de modèles de souris ou de patients pour fabriquer un petit modèle d'intestin humain, et les effets de différents traitements peuvent ensuite être explorés, ouvrant des voies pour la médecine de précision, entre autres.

Ces organoïdes peut également être modifié pour étudier l'importance relative de différents types de cellules dans le système et pour explorer les interactions entre différents gènes dans des cellules saines ou malades. Une question que se posent les scientifiques est de savoir si cet «enrichissement» des organoïdes, pour nous donner plus de cellules de Paneth ou de gobelets par exemple, nous donne un modèle réaliste. Le premier auteur du document est le suivant: «Sur la base de notre analyse transcriptomique, nous constatons une nette augmentation des types de cellules ciblées, comme nous nous attendions de l'utilisation des méthodes d'enrichissement organoïde.»

, nous permet de comparer l'expression des gènes dans les organoïdes qui sont enrichis pour les cellules de Paneth ou les cellules caliciformes avec celles qui ne le sont pas. Ceux-ci peuvent ensuite être comparés à une base de données croissante d'interactions géniques connues.

Essentiellement, nous pouvons étiqueter les gènes qui régulent les autres – en mettant en évidence en particulier ceux qui régulent de nombreux processus et sont importants pour la fonction cellulaire du gobelet et de Paneth. La découverte que bon nombre de ces gènes se chevauchent avec des processus inflammatoires et les MII confirme à la fois le rôle important des cellules de Paneth dans les MII et ouvre une autre voie pour comprendre cette gamme de maladies coûteuses.

Agatha Treveil poursuit: en établissant un pipeline pour mieux comprendre les réseaux de gènes en jeu dans l'intestin. Il nous permet de concevoir de nouvelles expériences pour explorer davantage les processus liés aux MICI. "

Dr Tamas Korcsmaros, le chef du projet, a déclaré:" Ce projet représente bien l'environnement de collaboration que nous avons au Norwich Research Park, l'UEA, l'IE et le QIB se concentrant sur de nouveaux modèles expérimentaux, la transcriptomique et les approches informatiques, puis en les appliquant dans des projets de traduction avec des chercheurs cliniques du Norfolk and Norwich University Hospital. nous avons un pipeline que nous pouvons utiliser pour enquêter sur les organoïdes générés par les patients atteints de MII, et analyser les effets des composés médicamenteux ou probiotiques sur ces cellules clés t ypes. "

Source de l'histoire:

Matériel fourni par Earlham Institute . Remarque: le contenu peut être modifié en fonction du style et de la longueur.

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